Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd1P30999 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms