Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd3P30282 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd3P30282 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms