Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrgP28705 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms