Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa2P28309 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms