Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms