Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb3P28231 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms