Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms