Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Xrcc5P27641 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Xrcc5P27641 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Xrcc5P27641 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc5P27641 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms