Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms