Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChgaP26339 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms