Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnna1P26231 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms