Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms