Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms