Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms