Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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