Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PparaP23204 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PparaP23204 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms