Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RarbP22605 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RarbP22605 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RarbP22605 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RarbP22605 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RarbP22605 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RarbP22605 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms