Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou3f1P21952 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms