Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms