Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms