Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka1P18653 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms