Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Svs4P18419 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Svs4P18419 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms