Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrphP15331 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms