Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms