Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms