Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nid1P10493 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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