Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PolP10400 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
PolP10400 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PolP10400 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PolP10400 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PolP10400 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PolP10400 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PolP10400 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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