Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl2P10148 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms