Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtaP09225 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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