Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtrP07309 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtrP07309 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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