Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms