Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01738 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01738 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01738 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01738 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01738 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01738 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms