Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms