Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccl20O89093 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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