Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx8O88983 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx8O88983 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms