Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms