Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc1O88447 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms