Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AvilO88398 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AvilO88398 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AvilO88398 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AvilO88398 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AvilO88398 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms