Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms