Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms