Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms