Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtssO70370 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtssO70370 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtssO70370 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtssO70370 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtssO70370 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms