Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HcrtO55241 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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