Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms