Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrxO55103 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrxO55103 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrxO55103 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrxO55103 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrxO55103 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrxO55103 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrxO55103 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrxO55103 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms