Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms