Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copb2O55029 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms