Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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