Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlkO54988 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlkO54988 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms