Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnk2O54967 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnk2O54967 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms